Document 2 : Séquence de la protéine CFTR avec Anagène et configuration spatiale avec le logiciel Rastop

29 août 2012 Par dboudeau

Pour Anagène :

  • Ouvrir le fichier CFTR.edi.
  • Effectuer une comparaison avec discontinuité des séquences d’ADN d’une part et des séquences protéiques d’autre part.
  • Noter la position avec précision le(s) type(s) de mutation(s).

Pour Rastop :

  • Ouvrir les 2 fichiers CFTR_mutante.pdb et CFTR_sauvage.pdb.
  • Cliquer sur l’icône « Fenêtres » et « Mosaïque verticale »
  • Pour chaque molécule, sélectionner successivement les acides aminés 506, 507 et 508 de la protéine normale. Colorer les acides aminés sélectionnés respectivement en bleu, vert et rouge.
  • Faire de même avec la protéine mutante.
  • Afin de mettre en évidence la différence entre les deux protéines CFTR, copier l’image des deux protéines les coller dans Photofiltre et légender les acides aminés colorés.